Решаем COVID-19: покеристы против коронавируса

Что такое сеть Rosetta@home? 

Rosetta@home — это объединение тысяч обычных ПК по всему миру, которые совместно занимаются расчетами по взаимодействию различных белков и сочетаний аминокислот. Это позволит смоделировать белки, из которых состоит оболочка COVID-19, и тем самым позволит нам создать лекарства и вакцины.

Такой белок и будет “вакциной” от коронавируса.

Каждый из нас может подключить свой компьютер к Rosetta@home, используя приложение, и внести свой вклад в ведущиеся расчеты, что позволит приблизить время создания вакцины.

Так как мы не являемся специалистами в молекулярной биологии, то весь нижеследующий текст мы получили от представителей сети Rosetta. 

Если где-то мы посчитали нужным сделать некоторые уточнения, то они будут помечены, как комментарий от редактора WPD.

BOINC и задачи научных исследований

Задача нахождения лекарств и методик борьбы с вирусами и бактериями сопряжена с большими вычислительными нагрузками. 

Ряд дорогостоящих экспериментальных исследований можно заменить моделями, просчитать все возможные состояния белков (свертку) и отобрать стабильные конфигурации. 

При этом необходимо проверить тысячи, а то и миллионы, различных комбинаций аминокислот за относительно короткое время. 

Это “простые”, но объемные вычисления, которые требуют тысяч процессоров и распределенную сеть. В ней объединены тысячи стационарных ПК со всего мира. Работает сеть с помощью приложения BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing).

BOINC разработан в Беркли, а это очень громкое имя в IT сфере.

Он объединяет в себе около двух десятков проектов (сетей). Самые известные из них — это проект SETI@home по поиску внеземной жизни и LHC@home — Большой Адронный Коллайдер.  

WPD: первый запуск сети прошел в 2005 году.

Сеть Rosetta

Сейчас нас интересует только сеть Rosetta@home. 

Именно в ней в данный момент проходят вычисления по COVID-19. Вычисления идут на центральном процессоре СPU, так что абсолютно все вычислительные устройства могут участвовать.

Курируют Rosetta@home:

• Медицинский институт Говарда Хьюза. 
• Национальный Институт Здоровья.
• Национальный Научный Фонд США.
• Университет Вашингтона.
• Fold.it — разработчики сети.

Все организации — non-profit. Результаты и данные будут опубликованы в открытом виде и доступны всем.

WPD: на сайте проекта есть более подробное описание сути его работы, но и с использованием научного языка. Есть много ссылок на статьи и отчеты по работе сети в различных западных изданиях: например, вот здесь. 

Описание сети есть и в Википедии.

Как стать участником сети Rosetta?

1. Для это скачиваем дистрибутив BOINC по ссылке и устанавливаем приложение.
2. 
3. Выбираем путь установки. Галочки Use BOINC Screenserver (показ результатов расчетов в реальном времени на экране в качестве защитника экрана) и Service Install ставьте по желанию.
4. 
5. В BOINC представлены около двух десятков проектов. Нас интересует Rosetta@home. Выбираем сеть и подключаемся к ней.
6. 
7. Проходим регистрацию.
8. 
9. Указываем свой ник или реальное имя.
10. Вас попросят присоединиться к команде. Они занимаются работой над отдельными задачами в рамках сети. Этот шаг можно пропустить.
11. Если вы считаете, что скачивать exe или ставить "непонятным пакетом — ужас и кошмар", а исходники наше все, то вам сюда.
12. 
13. Для комфортной повседневной работы приложение обеспечено глубокими настройками. Можно настроить процент процессорного времени, ограничение по сети, а также временные ограничения, реакцию на простой и т.д.

Важно! 

BOINC реально считает. И у этих расчетов есть дедлайны. Обратите на это внимание, когда будете планировать, сколько отдадите ресурсов на вычисления.

Авторы: Pan'kin 'UpPingwin' Artyom, Sergey M, Petr Andreev.

Участие покерного комьюнити в решении COVID-19

Команда Worldpokerdeals уже выделила часть мощностей своих ПК на расчеты в сети Rosetta@home и приглашает все покерное комьюнити принять в ней участие. 

Ваша помощь приблизит время появления вакцины от коронавируса и может спасти тысячи жизней.